%0 Journal Article
%A 刘洪伟
%A 邱德有
%A 吴国江
%A 吴平治
%A 熊王丹
%A 杨艳芳
%T 不同植物中推定蓖麻烯合酶基因的生物信息学分析
%D 2016
%R 10.7525/j.issn.1673-5102.2016.04.017
%J 植物研究
%P 605-612
%V 36
%N 4
%X 利用GenBank中已登录的完整的麻风树、乳浆大戟、蓖麻和乌桕中的13个蓖麻烯合酶(Casbene synthase,CS;EC 4.6.1.7)基因序列,通过生物信息学方法对其核酸及氨基酸序列、组成成分、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质的二级结构、三级结构及功能域等进行了分析预测。结果表明,13个<em>CS</em>基因的ORF长度均在1647~1845 bp,蛋白分子量均在63.0~70.8 kD,终止密码子为TGA或TAA,理论等电点均小于7.0,表明CS蛋白呈酸性。氨基酸含量最高的均为亮氨酸。核苷酸同源性比较分析表明,<em>CS</em>基因主要分为两类。导肽预测发现其中6个CS具有导肽,均为叶绿体导肽。信号肽和扩模结构域预测发现这些CS不存在信号肽和跨膜结构域,肽链整体呈现为亲水性。这些CS的主要二级结构元件为&alpha;-螺旋,并且都包含两个萜类合酶功能域。以上研究为进一步探索<em>CS</em>基因的功能提供一定理论依据。
%U https://bbr.nefu.edu.cn/CN/10.7525/j.issn.1673-5102.2016.04.017